Flytgödselspridare spiller nästan alltid lite gödsel från slangarna även när den körs i transport. Denna gödsel kan ge upphov till smittspridning. På gårdar där man har transportvägar förbi kalvstallen mellan flytgödselbehållare och fält är risken stor att man sprider smitta. Största är problemet när man anlitar maskinstation som kör på flera gårdar.
Rådgivare i Danmark vill göra animalieproducenter uppmärksamma på denna fara och rekommenderar alla att fundera över logistiken i flytgödselhanteringen så att smittspridningen elimineras.